新生兒打預防針

請問各位媽媽 ，我女兒9月底出生現在住林口，
因為我家住高雄，打算過年那段時間留在高雄兩個月。但我看寶寶手冊需要打預防針，請問跨院打預防針可以嗎？有需要注意什麼事情嗎？有推薦的醫院嗎？